曝气池的生物泡沫一般是有黏滞性，它会将大量活性污泥等固体物质卷入曝气池的漂浮泡沫层，泡沫层在曝气池表面翻腾，阻碍氧气进入曝气池混合液，降低充氧效率，尤其对机械表曝方式影响最大。
当混有泡沫的曝气池混合液进入二沉池后，在二沉池表面形成大量浮渣，增加出水悬浮物含量，影响出水水质，同时在冬季气温较低时会因结冰影响二沉池吸(刮)泥桥(机)的正常运转。
生物泡沫蔓延到走道板上，影响巡检和设备维修。夏季生物泡沫随风飘荡，产生一系列环境卫生问题，影响周围人的卫生健康。冬季结冰后，清理困难，还可能滑倒巡检和维修人员。
回流污泥中含有泡沫会引起类似的浮选现象，损坏污泥正常性能，生物泡沫随排泥进入泥区，干扰污泥浓缩和污泥消化的顺利进行。
